Il tema principale è rappresentato dalla fauna acquatica del Mediterraneo. Il centro, dedicato all’educazione ambientale, è costituito da 3 diverse sezioni.
- Aquarium: presenta le specie ittiche tipiche del Mare Mediterraneo (orate saraghi, murene, donzelle pavonine, cernie, corvine, mormore, spigole) ed il ruolo da esse svolto nell’ecosistema marino e lagunare.
- Sala del Benthos: in questa sala sono ospitati, divisi in tre diverse vasche, gli organismi della fauna acquatica che vivono sul fondo del mare e vegetali acquatici, tra questi la Posidonia oceanica, determinante per la conservazione dei delicati equilibri che regolano l’ecosistema marino.
- Sala audiovisivi: dei video illustrano il funzionamento della laguna, le maree, lo sfruttamento a fini di pesca, la sua conservazione.
- Sentiero-natura: il percorso si snoda nella penisola di Fradis Minoris, fornendo informazioni sull’ecosistema lagunare, sulla macchia mediterranea termofila e sulla vegetazione delle zone umide.
- Padiglione cetacei: una grande vasca circolare è adibita all’ospedalizzazione dei delfini e delle tartarughe marine spiaggiate, attività che il Centro porta avanti in collaborazione con il Centro Studi Cetacei.









